Flygbolaget varnar också för att resultatet under första kvartalet och även helåret kommer att påverkas, rapporterar CNBC.
Fackförbundet Ufos strejkvarsel omfattar flyg från Frankfurt på tisdag och från München på onsdag. Fientligheterna börjar klockan fyra på morgonen och slutar klockan elva på kvällen båda dagarna.
Fackets ledare Joachim Vázquez Bürger säger att personalen måste få del av flygbolagets vinst och en belöning för sina insatser under pandemin.
Strejken är en av flera som har utlysts eller genomförts inom den tyska transportsektorn de senaste veckorna. Bland annat har Lufthansas markpersonal och anställda på det statligt ägda tågbolaget Deutsche Bahn periodvis strejkat.
