Rättegången gäller misstänkta skattebrott på 1,4 miljoner dollar åren 2016-2019.
Hunter Bidens advokat, Abbe Lowell, sa tidigare torsdag att bevisen mot presidentens son är överväldigande och att Biden skulle erkänna sig skyldig men hävda att han inte begick brottet medvetet.
Det godtog dock inte åklagaren i målet.
– Han har inte rätt att erkänna sig skyldig på grunder som bara gäller honom, sa åklagare Leo Wise.
Det mesta tydde därför på att en rättegång skulle börja, ett juryval var bara timmar bort när det nya beskedet kom. Nu blir det ingen rättegång.
I ett uttalande sa Hunter Biden att han valde att erkänna sig skyldig för att skona sin familj ytterligare en rättegång.
“Jag kommer inte att utsätta min familj för mer smärta, mer intrång i privatlivet och onödig förlägenhet. Jag har utsatt dem för mycket genom åren men jag kan bespara dem det här, och därför har jag beslutat att erkänna mig skyldig”, skriver han i uttalandet.
Domen meddelas den 16 december.
Hunter Biden har tidigare dömts för illegalt vapeninnehav i elva dagar; han ljög när han ansökte om licens för vapnet – vilket kan ge honom ett fängelsestraff. Biden hade missbruksproblem när brotten begicks.